南宋末年，石塘村的村民为躲避元军，迁居岛上渔耕为生。

后元军烧毁民房，强令村民迁回原处，加上岛上布满如烈火烧过的彩色岩石，故称"火烧屿"。

七十年代市园林部门对火烧屿实行封山育林，植树绿化。

火烧屿上有四个人工湖，二大二小，三个淡水湖，一个海水湖，共6万多平方米。"二小"名曰：鹭栖、鹭林。待到清风皓月，伫立观景塔上，只见四个湖里各储一轮明月，形成独有的"四潭印月"胜景，海风轻轻吹，月光悠悠倩，此乃"东渡飞虹"赏景的最佳时节。

静月湖有小竹屋，游人可来此小住，可捉鱼摸蟹、烧烤野炊。还可徜徉于湖边林下，松弛一下紧张繁杂的身心，收拾畅舒轻松的时光。翠月湖连着200米的小溪，曲折跌岩，流水淙淙，鸟鸣禽欢，人禽同乐，形成人与禽鸟无边界的自然交流。

鹭栖湖有3万多平方米的水面，湖中的鹭栖岛，晶莹透亮，荡浆湖内，情趣盎然，玩得累时，可上岛休憩、垂钓，是放飞心情恢复疲劳的上佳去处。鹭林湖为海水湖，也有3万多平方米的水面，湖中的鹭林岛，可享受日光浴。湖边的临水平台可即兴表演，尤其可为未能畅游大海的游人体味没有汹涌海潮的大海滋味。

彩岩观赏区火烧屿东南临海，有一片怪岩奇石，有"火烧石"、"蠕虫遗迹石"、"刀砍石"、"菊花石"、"云状石"等，色彩斑斓，造型奇特，酷似"雄狮枕海""苍鹰展翅"。游人可步行腾空架设的藤桥栈道、使双脚不致踩到岩体表面，以保护这彩岩景观。岩下正对厦门市区和鼓浪屿，将建一处观光平台，让游人欣赏彩岩全貌，踏沙浴海，以充实游兴。

此外，火烧屿生态园将开展海上游览活动，舒适的游艇，南可至屿仔尾、青屿、浯屿、北可达宝珠屿，以至环游厦门岛，海上看厦门，海上看金门。